Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms