Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDM5DQ9BY66 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDM5DQ9BY66 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms