Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VN1R3Q9BXE9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms