Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP2Q9BX26 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms