Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TUBB6Q9BUF5 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms