Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms