Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3R4Q99570 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms