Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms