Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms