Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLIP3Q96DZ5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms