Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC1Q96C34 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms