Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MKL1Q969V6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms