Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF3C6Q969F1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms