Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms