Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCSTNQ92542 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms