Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RB1CC1Q8TDY2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms