Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHD5Q8TDI0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms