Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BEST4Q8NFU0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BEST4Q8NFU0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BEST4Q8NFU0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BEST4Q8NFU0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BEST4Q8NFU0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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