Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM35BQ8NCS4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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