Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms