Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms