Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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TRAPPC6BQ86SZ2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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