Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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USP53Q70EK8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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USP53Q70EK8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP53Q70EK8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP53Q70EK8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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USP53Q70EK8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP53Q70EK8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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