Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIGD1Q6UXZ0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms