Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms