Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PXDC1Q5TGL8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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