Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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COL5A1-AS1Q5SY13 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
COL5A1-AS1Q5SY13 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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