Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTXN3Q4LDR2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms