Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTLL9Q3SXZ7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms