Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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KRTAP24-1Q3LI83 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
KRTAP24-1Q3LI83 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
KRTAP24-1Q3LI83 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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