Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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