Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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