Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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HIF1AQ16665 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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