Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCAQ16586 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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SGCAQ16586 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SGCAQ16586 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SGCAQ16586 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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