Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ACKR1Q16570 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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