Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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