Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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