Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP4Q15650 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms