Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TAF1AQ15573 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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