Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRRQ15256 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRRQ15256 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms