Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHPRHQ149N8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHPRHQ149N8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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