Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIXQ14938 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFIXQ14938 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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