Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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KCNC3Q14003 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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KCNC3Q14003 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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