Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PKP1Q13835 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PKP1Q13835 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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