Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA5AQ13591 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA5AQ13591 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms