Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CAMK2DQ13557 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms