Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPM6BQ13491 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms