Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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