Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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