Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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GPS1Q13098 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPS1Q13098 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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